La importancia de la designación de esta área como Área Protegida garantiza la conservación de la fauna autóctona afectada por las actividades humanas. La caza y el aumento de la cantidad de animales domésticos, son las principales causas de la desaparición de especies animales nativas lo cual afecta a todos los ecosistemas.

Viven allí gran variedad de insectos, anfibios, reptiles, entre ellos una culebra muy poco frecuente: la culebra "Almada". Dentro del grupo de aves se detectaron más de 100 especies que incluyen algunas de particular interés de conservación como la "Seriema".

Veinte son las especies de mamíferos encontradas. Importante es destacar la presencia del "Lobito de Río" y el "Guazú Virá", especies con problemas de extinción.

Están presentes especies altamente perseguidas por cazadores como el "carpincho", el "tatú", la mulita, el "peludo" y la "nutria".

También son habitantes de la reserva los "murciélagos orejudos" una especie cuyo estudio es de interés científico.